國家人權博物館所藏「財團法人戒嚴時期不當叛亂暨匪諜審判案件補償基金會」補償卷宗檔案，除了包含受裁判人的補償審核等相關資訊外，亦針對受裁判人所涉案件之相關資訊，例如出生資訊、籍貫、《戒嚴時期叛亂暨匪諜案件調查報告》事件名稱、《戒嚴時期叛亂暨匪諜案件調查報告》罪名、所犯法條與軍事檢察官、審判官、書記官、辯護人等。

「國家發展委員會檔案管理局（簡稱檔案局）」典藏的政治類檔案。檔案局透過政治檔案徵集工作，典藏有關二二八事件、軍事審判與重大政治事件檔案。檔案局目前按〈政治檔案分類編碼架構〉對政治類檔案進行分類，其中有關於「開庭-判決階段」檔案佔總量（約136萬頁）的30.1%，約為41萬頁左右。本館與檔案局所典藏的檔案可以彼此互補，達到清查政治案件與整理軍事審判流程的目的。

「促進轉型正義委員會」及「法務部」依循〈促進轉型正義條例〉公告平復司法不法及行政不法名單，其中司法不法案件來自威權統治時期違反自由民主憲政秩序、侵害公平審判原則所追訴或審判之刑事案件含(軍事)法院裁判、處分及(軍事)檢察官處分；而行政不法案件來自威權統治時期政府機關或公務員為達成鞏固威權統治之目的，違反自由民主憲政秩序，所為侵害人民生命、人身自由或剝奪其財產所有權之處分或事實行為。